タイトルのまんまですね。

非表示になっているレイヤーを↙、(1,2のレイヤ―素材)

一括削除する方法です↙

手順

レイヤーパネル、右上のパネルオプションから、「非表示レイヤーを削除」を選択

非表示になっていたレイヤーが一括で消えます↙

「メニューバー➡レイヤー➡削除➡非表示レイヤー」からも一括削除が可能。

お試しあれ。